Территория Танзании захватывает часть крупнейших озёр Африки — озеро Виктория на севере, озеро Танганьика (самое длинное в мире пресноводное озеро, которое часто называют двойником Байкала) на западе, и озеро Малави (Ньяса) — на юге Танзании.
Из более чем 200 разновидностей обитающих в озере Танганьика рыб около 170 эндемичны. Озеро Малави (Ньяса) имеет самую разнообразную экосистему среди пресноводных водоёмов мира, в нём живёт почти 1000 видов рыб. В озере представлены одиннадцать семейств, но одно из них — цихлиды (Cichlidae) — охватывает 90 % видов озёрных рыб, большая часть которых — эндемики.